"update 2, из комментариев:

Всем привет, для тех, с кем незнакомы — Марина Акулич, блог-секретарь МТС.
По ситуации могу сказать следующее (официальный комментарий компании: на данный момент интернет-абонентам МТС НЕ запрещается использовать программы для передачи голосовой информации, такие как Skype и ей подобные. Естественно, установка и использование данных программ НЕ блокируется и услуги предоставляются в полном объеме.

Проблема произошла из-за того, что на сайте была размещена устаревшая версия договора. Этот пункт, в котором говорится о запрете программ для передачи голосовой информации был включен еще компанией «Комстар-Директ», когда у них компании не было лицензии на предоставление услуг связи по передаче голосовой информации в сети передачи данных.
Мы сейчас обновляем все абонентские договоры, и, конечно, данный пункт из новой версии договора будет исключен. "